De kleuren van boxervacht zijn relatief eenvoudig. Alle raszuivere boksers hebben een zwart masker op de snuit, hoewel deze gedeeltelijk of volledig bedekt kan zijn met witte aftekeningen.
Fawn
Fawn is een effen kleur, variërend van lichtbruin tot donker roodachtig. De donkere reekalfjes worden soms mahonie of hertenrood van kleur genoemd - in sommige landen wordt de term "rood" zelfs gebruikt in plaats van reekalf om de kleur te beschrijven. Bij donkerdere reekalfjes kunnen wat zwarte haren tussen de vacht zitten, of de reekalfharen kunnen zwart zijn. Dit kan kleine zwarte gebieden of "vlekken" op delen van de vacht veroorzaken, vooral de randen van de oren.
Gestroomd
De andere kleur in de AKC boxer-standaard is gestroomd, wat zwarte strepen op de reekalfbasislaag zijn. Technisch gezien zijn alle boksers reekalf - gestroomd is een markeringspatroon in plaats van een werkelijke kleur. Het is echter veel gemakkelijker om gestroomd een kleur te noemen, en die conventie werkt al een eeuw goed. Gestroomde boksers kunnen maar een paar strepen op hun reekalf hebben - soms gekscherend "frindles" genoemd. Aan de andere kant van het spectrum kunnen de strepen zwaar genoeg zijn om, zoals de American Kennel Club-standaard beschrijft, "het uiterlijk van omgekeerd gestroomd" te creëren, aangezien het lijkt alsof reekalfstrepen op een zwart lichaam zijn geverfd. De reekleurige basiskleur moet echter altijd zichtbaar zijn, ook al is het maar op een paar kleine plekken op het lichaam.
Wit
Wit is een ander markeringspatroon - genetisch gezien zijn alle witte boksers ofwel reekalf of gestroomd onder de witte "verfbeurt". De hoeveelheid witte aftekeningen kan aanzienlijk variëren, van geen tot 100 procent dekking. Boxers met witte aftekeningen die een derde of minder van het lichaam bedekken, worden "flitsend" genoemd. Deze markeringen zijn meestal te vinden op de voeten, benen, nek en gezicht. Wanneer het grootste deel van het lichaam wit is, wordt de hond een witte bokser genoemd - opnieuw technisch niet correct, maar op die manier is het gemakkelijker. Witte boksers hebben vaak kleurvlekken, meestal op de oren of rond de ogen en soms op de rug. De AKC biedt registratiecodes voor zowel witte aftekeningen als wit als kleur.
Witte boksers zijn niet zeldzaam of ongebruikelijk; hoewel officiële statistieken niet zijn bijgehouden, is een redelijke schatting dat ongeveer 20 procent van alle boksers wit is. Honden waarvan meer dan een derde van hun lichaam wit bedekt, worden door de rasstandaard gediskwalificeerd voor hondenshows en mogen volgens de ethische code van de ouderclub niet fokken. Witte boksers kunnen deelnemen aan gehoorzaamheid, behendigheid, hoeden, coursing, rally en andere activiteiten.
Genetica
De genetica van de kleuren van boxervacht is duidelijk. Brindle is dominant voor reekalf, wat betekent dat een hond met zelfs maar één gestroomd gen gestroomd zal zijn. Modificatoren, in plaats van het gestroomde gen, bepalen het aantal gestroomde strepen op een bokser - een hond met twee gestroomde genen kan al dan niet meer strepen hebben dan een hond met één gestroomd gen. Witte aftekeningen worden veroorzaakt door het extreem bonte gen en zijn co-dominant. Een hond met één wit gen zal opvallend zijn, terwijl een hond met twee witte genen grotendeels of helemaal wit zal zijn.
Zwart
Een groeiend aantal fokkers verkoopt "zwarte boksers", die vaak als "zeldzaam" op de markt worden gebracht en voor hoge prijzen worden verkocht. Helaas is een zwarte jas genetisch onmogelijk voor een bokser en geeft de AKC geen kleurcode voor zwart. De enige manier om een zwarte vacht te krijgen, is door een bokser te kruisen met een ander ras. Omdat zwart dominant is ten opzichte van reekalf en gestroomd, kan het niet generaties lang "verborgen" blijven; als de hond één gen heeft voor zwarte vachtkleur, zal hij een zwarte vacht hebben.
